能处理，但是有一个前提条件该违章的车是在上面进行过备案的车辆 。若是备案成功，则可以通过12123来查询和处理单位车辆的交通违法信息 。若无备案则不能处理 。
法律依据：
《道路交通安全法》第八十七条
公安机关交通管理部门及其交通警察对道路交通安全违法行为，应当及时纠正 。公安机关交通管理部门及其交通警察应当依据事实和本法的有关规定对道路交通安全违法行为予以处罚 。对于情节轻微，未影响道路通行的，指出违法行为，给予口头警告后放行 。
【12123能处理公司车违章吗】《道路交通安全法》第八十八条
对道路交通安全违法行为的处罚种类包括：警告、罚款、暂扣或者吊销机动车驾驶证、拘留 。
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