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乙脑病毒属披膜病毒科黄病毒属，呈球型，直径20～30nm ， 核心含单股RNA，有衣壳 。
在脂蛋白囊膜表面有血凝素刺突 ， 能凝集鸡、鹅、羊等动物红细胞 。抗原性稳定，但近年有报告以具有中和作用的单克隆抗体(McAb)检测15株国内的乙脑病毒时，可将其分为4个抗原组 。
人和动物感染本病毒后，均产生补体结合抗体 ， 中和抗体和血凝抑制抗体 。
【流行性乙型脑炎病原学】本病毒在外界环境中抵抗力不强，56℃30分钟或100℃2分钟即可灭活 。但对低温和干燥的抵抗力很强 ， 用冰冻干燥法在4℃冰箱中可保存数年 。

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