由黑社会性质组织所在地的公安机关进行管辖办理 。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第109条 ， 公安机关或者人民检察院发现犯罪事实或者犯罪嫌疑人，应当按照管辖范围，立案侦查 。
【涉黑性质的案件哪里办理】《刑事诉讼法》第112条 ， 人民法院、人民检察院或者公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候 ， 应当立案 。认为没有犯罪事实，或者犯罪事实显著轻微，不需要追究刑事责任的时候，不予立案 ， 并且将不立案的原因通知控告人 。控告人如果不服，可以申请复议 。

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